Se durante la procedura di shutdown uno dei job si blocca con la dicitura "A stop job is running..." di solito rimane bloccato per 1 minuto e mezzo! Se capita significa che qualcuno dei task di chiusura ha dei problemi, e quindi la soluzione corretta sarebbe indagare sullo specifico servizio systemd, guardare i log, capire e risolvere il problema. Intanto però abbassare quel minuto e mezzo aiuta!
Basta modificare la voce "DefaultTimeoutStopSec" all'interno del file "/etc/systemd/system.conf", impostandola ad esempio a "10s".